聚丙烯酰胺凝膠電泳色譜儀是以聚丙烯酰胺凝膠作為支持介質(zhì)進(jìn)行電泳分離，聚丙烯酰胺凝膠具有機(jī)械強(qiáng)度好、有彈性、透明、化學(xué)性質(zhì)穩(wěn)定、對(duì)pH和溫度變化小、沒(méi)有吸附、電滲作用小等特點(diǎn)，是一種很好的支持介質(zhì)。

　　一、聚丙烯胺凝膠聚合方式：

　　聚丙烯酰胺凝膠是由單體丙烯酰胺（CH2 = CH－CO－NH2，簡(jiǎn)稱Acr）和交聯(lián)劑N，N′－甲叉雙丙烯酰胺（CH2 = CH－CO－NH－CO－CH = CH2，簡(jiǎn)稱Bis）在催化劑過(guò)硫酸銨（AP）和加速劑N，N，N′，N′－四甲基乙二胺（TEMED）作用下聚合交聯(lián)而成的三維網(wǎng)狀凝膠，凝膠孔徑大小由丙烯酰胺的濃度決定。

　　二、電泳類型：

　　1、非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳：

　　在不含變性劑的中性聚丙烯酰胺凝膠中電泳時(shí)，DNA單鏈的遷移率除與DNA鏈的長(zhǎng)短有關(guān)外，更主要的是取決于DNA單鏈所形成的構(gòu)象。在非變性條件下，DNA單鏈可自身折疊形成具有一定空間結(jié)構(gòu)的構(gòu)象，這種構(gòu)象由DNA單鏈堿基決定，其穩(wěn)定性靠分子內(nèi)局部順序的相互作用（主要為氫鍵）來(lái)維持。相同長(zhǎng)度的DNA單鏈其順序不同，甚至單個(gè)堿基不同，所形成的構(gòu)象不同，電泳遷移率不同。

　　由于分子的空間結(jié)構(gòu)影響，同等大小的DNA之間的電泳遷移率可相差10%。因此，不能用非變性聚丙烯胺凝膠電泳判斷DNA分子大小。

　　2、變性聚丙烯胺凝膠電泳：

　?。?）DNA變性：采用加熱、極端pH、有機(jī)溶劑、尿素或甲酰胺導(dǎo)致DNA解鏈。

　　（2）凝膠中加入變性劑：5M的尿素，使DNA為單鏈線性，變性DNA的移動(dòng)速度與其堿基組成和序列幾乎完全無(wú)關(guān)。

　　變性聚丙烯胺凝膠電泳可用于DNA序列分析等。

　　三、應(yīng)用：

　　聚丙烯酰胺凝膠電泳適于分離小分子量蛋白質(zhì)、小于1Kb的DNA片段和DNA序列分析，裝載的樣品量大，分辨率高，回收DNA純度高即能分離長(zhǎng)度僅相差0.2%（即500bp中的1bp）的核苷酸分子。